MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 2897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018622	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018622	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018622	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018622	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018622	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018622	TAT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018622	ATT	3	9	3072	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018622	TGT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018622	T	6	6	3101	3106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018622	CAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018622	TTG	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018622	AATC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018622	GAAT	2	8	6851	6858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018622	GAA	2	6	6880	6885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018622	AAT	2	6	16849	16854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018622	TTA	2	6	16929	16934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018622	AAT	2	6	17007	17012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018622	TAAA	2	8	17023	17030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018622	TTTC	2	8	17680	17687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018622	AG	3	6	17696	17701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018622	TCC	2	6	18547	18552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018622	GTT	2	6	20322	20327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018622	TCC	2	6	20328	20333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018622	TTA	2	6	20338	20343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018622	T	6	6	20377	20382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018622	TCT	2	6	20386	20391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018622	AAT	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018622	TAA	2	6	21722	21727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018622	T	9	9	21769	21777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018622	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018622	T	6	6	21809	21814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018622	TTC	2	6	23766	23771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018622	T	7	7	23802	23808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018622	TGA	3	9	23843	23851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018622	AAG	2	6	23888	23893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018622	ATT	2	6	26534	26539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018622	T	7	7	26577	26583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018622	TTC	2	6	26613	26618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018622	ATTT	2	8	26654	26661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018622	ATTA	2	8	26665	26672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018622	TTA	2	6	26696	26701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018622	A	6	6	30334	30339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018622	TTG	2	6	30760	30765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018622	TTTC	2	8	31646	31653	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018622	AGG	2	6	31740	31745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018622	T	6	6	31764	31769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018622	TC	3	6	31846	31851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018622	AGA	2	6	31963	31968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018622	CTT	2	6	31978	31983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018622	TCTA	2	8	32050	32057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018622	A	6	6	32359	32364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018622	AATT	2	8	32374	32381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018622	AAT	2	6	32403	32408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018622	TTAA	2	8	32414	32421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018622	TTA	2	6	33424	33429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018622	AAG	2	6	33445	33450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018622	A	6	6	33501	33506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018622	TTAA	2	8	33510	33517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018622	TGT	3	9	33524	33532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018622	AGAT	2	8	33553	33560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018622	AAG	2	6	33569	33574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018622	ATTTAA	2	12	33592	33603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018622	TGG	2	6	34226	34231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018622	ATAAA	2	10	34281	34290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018622	A	6	6	34298	34303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018622	TTC	2	6	37585	37590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018622	TTC	2	6	37626	37631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018622	TGC	2	6	37674	37679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018622	TC	3	6	37736	37741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018622	TCAA	2	8	37775	37782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018622	AGA	2	6	37864	37869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018622	TAT	2	6	38099	38104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018622	ATC	2	6	39298	39303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018622	TTTTTA	2	12	39391	39402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018622	GAA	2	6	39475	39480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018622	TTA	2	6	42381	42386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018622	GAA	2	6	42403	42408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018622	AGT	2	6	42692	42697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018622	TTTTAA	2	12	42715	42726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018622	CAA	2	6	42767	42772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018622	A	6	6	43432	43437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018622	GTT	2	6	43444	43449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018622	GAC	2	6	44136	44141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018622	ACG	2	6	44171	44176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018622	GTCG	2	8	44194	44201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018622	GTC	2	6	44212	44217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018622	GAA	2	6	49507	49512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018622	ATAA	2	8	49527	49534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018622	A	6	6	49536	49541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018622	TA	3	6	52210	52215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018622	GAT	2	6	52226	52231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018622	TCG	2	6	52293	52298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018622	TTG	2	6	52308	52313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018622	T	6	6	52324	52329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018622	T	8	8	52359	52366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018622	GTC	2	6	52412	52417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018622	A	6	6	52448	52453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018622	TTTTG	2	10	52483	52492	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018622	AAG	2	6	52512	52517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018622	AAAG	2	8	52607	52614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018622	TTTA	2	8	52617	52624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018622	A	6	6	54475	54480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018622	T	7	7	54500	54506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018622	AAT	2	6	54528	54533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018622	AAAG	2	8	54785	54792	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018622	GTT	2	6	57779	57784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018622	TGG	2	6	57859	57864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018622	TTAAT	2	10	57963	57972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018622	GGT	2	6	58088	58093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018622	A	8	8	58097	58104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018622	TCTTT	2	10	59407	59416	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018622	GGC	2	6	59446	59451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018622	GAG	2	6	59505	59510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018622	ATT	2	6	59554	59559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018622	TTA	2	6	59581	59586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018622	A	6	6	59603	59608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018622	TAA	2	6	59655	59660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018622	AGA	2	6	59731	59736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018622	GTTT	2	8	59891	59898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018622	TATG	2	8	59906	59913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018622	CTA	2	6	59970	59975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018622	CAA	2	6	63294	63299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018622	TG	3	6	63303	63308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018622	TTG	2	6	64375	64380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018622	A	8	8	64385	64392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018622	GAA	2	6	64403	64408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018622	TCC	2	6	64488	64493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018622	CTTT	2	8	64566	64573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018622	AAT	2	6	64634	64639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018622	T	7	7	71070	71076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018622	A	7	7	71120	71126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018622	CACTT	2	10	71128	71137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018622	ATA	2	6	71236	71241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018622	T	6	6	72121	72126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018622	TTA	3	9	74088	74096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018622	ATC	2	6	76085	76090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018622	TCA	2	6	77410	77415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018622	TTC	2	6	77487	77492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018622	TAT	2	6	77519	77524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018622	TAAT	2	8	77659	77666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018622	TATT	2	8	77676	77683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018622	TTAA	2	8	77685	77692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018622	TAAA	2	8	77716	77723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018622	ATTA	2	8	77733	77740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018622	AATTT	2	10	77741	77750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018622	ATTATA	2	12	77755	77766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018622	TAT	2	6	77778	77783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018622	TTC	2	6	80573	80578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018622	A	6	6	80583	80588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018622	AAT	2	6	80595	80600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018622	TAAG	2	8	80616	80623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018622	T	6	6	81806	81811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018622	TGT	2	6	81816	81821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018622	T	6	6	81863	81868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018622	T	6	6	81878	81883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018622	CAA	2	6	81901	81906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_018622	AAT	2	6	83436	83441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018622	AGT	2	6	83449	83454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018622	AAAG	2	8	83485	83492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018622	AGAAA	2	10	87358	87367	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018622	GTT	2	6	87387	87392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018622	TTTA	2	8	87398	87405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018622	T	7	7	87416	87422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018622	T	6	6	87436	87441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018622	ATAA	2	8	87452	87459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018622	T	6	6	87465	87470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_018622	ATC	2	6	93416	93421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_018622	A	6	6	93549	93554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018622	AAG	2	6	93556	93561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_018622	AAT	2	6	93642	93647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_018622	TTG	2	6	93680	93685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_018622	GA	3	6	97073	97078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018622	AAG	2	6	98671	98676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_018622	ATG	2	6	99375	99380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_018622	ATA	2	6	99428	99433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_018622	GTT	2	6	99461	99466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018622	ACT	2	6	99533	99538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_018622	ATC	2	6	99555	99560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_018622	TAG	2	6	99589	99594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_018622	AAT	2	6	125766	125771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_018622	ATT	2	6	128309	128314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_018622	TG	4	8	128429	128436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
254	NC_018622	T	6	6	128443	128448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_018622	TGT	2	6	128540	128545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_018622	TTTA	2	8	128693	128700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_018622	T	7	7	130630	130636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018622	TAA	2	6	130649	130654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_018622	TAA	2	6	130783	130788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_018622	ATT	2	6	130799	130804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_018622	TAA	2	6	130817	130822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_018622	TTCTT	2	10	131362	131371	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
277	NC_018622	TGT	2	6	131448	131453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_018622	CAA	2	6	131486	131491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_018622	TAT	2	6	131493	131498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_018622	TCA	2	6	131591	131596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_018622	AT	3	6	131639	131644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018622	ATT	2	6	131703	131708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018622	CCT	2	6	131710	131715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_018622	T	8	8	133267	133274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_018622	TAT	2	6	133302	133307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_018622	GA	3	6	134362	134367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018622	ACC	2	6	139008	139013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_018622	TGA	2	6	139101	139106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018622	TGAT	2	8	139124	139131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_018622	A	7	7	139539	139545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_018622	T	6	6	193913	193918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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